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はじめに
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ImageJは、CT画像のROI(関心領域)を抽出し、連続画像を作成するための強力なツールです。
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ROIを抽出するには、ImageJのROI Managerを使用します。ROI Managerは、複数の選択範囲を管理し、保存することができます。
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連続画像を作成するには、ImageJのマクロ機能を利用して、複数の画像を一括処理することが可能です。
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マクロを使用することで、特定のROIを抽出し、それを連続画像として保存するプロセスを自動化できます。
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ImageJのプラグインやマクロを活用することで、ユーザーオリジナルの画像処理を実現できます。
ROIの抽出方法 [1]
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ROI Manager: ImageJのROI Managerを使用して、関心領域を選択し、保存します。
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選択範囲の管理: 複数の選択範囲を同時に管理し、異なる画像やスライスに適用可能です。
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保存と呼び出し: 保存したROIを後で呼び出して再利用することができます。
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ROIの編集: 選択したROIを編集し、必要に応じて調整することが可能です。
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ROIのエクスポート: ROIを他の形式でエクスポートし、他のソフトウェアで使用することもできます。
連続画像の作成 [2]
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画像のインポート: ImageJのFile/Import/Image Sequenceを使用して、フォルダ内の画像をスタックとして開きます。
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スタックの作成: 連続するスライスのDICOMファイルをスタックとしてまとめることができます。
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画像の保存: 処理した連続画像をTiff形式で保存することが可能です。
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画像の編集: 連続画像を編集し、必要に応じて調整することができます。
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画像のエクスポート: 連続画像を他の形式でエクスポートし、他のソフトウェアで使用することもできます。
マクロの利用 [3]
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マクロの作成: ImageJのマクロエディタを使用して、独自のマクロを作成します。
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マクロの実行: 作成したマクロを実行し、画像処理を自動化します。
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マクロのインストール: マクロをインストールして、メニューから簡単に実行できるようにします。
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マクロの編集: 必要に応じてマクロを編集し、処理内容を調整します。
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サンプルマクロ: ImageJのサイトには多くのサンプルマクロがあり、参考にすることができます。
プラグインの活用 [3]
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プラグインのインストール: ImageJのプラグインをインストールして、機能を拡張します。
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Volume Viewer: 三次元画像処理プラグインを使用して、スタックを作成します。
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プラグインの実行: プラグインを実行して、特定の画像処理を行います。
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プラグインの編集: 必要に応じてプラグインを編集し、処理内容を調整します。
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サンプルプラグイン: ImageJのサイトには多くのサンプルプラグインがあり、参考にすることができます。
ImageJの機能 [3]
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基本機能: ImageJは、画像の表示、編集、解析を行うための基本機能を備えています。
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拡張機能: プラグインやマクロを使用して、機能を拡張することができます。
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ユーザーインターフェース: 使いやすいインターフェースで、初心者でも簡単に操作できます。
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コミュニティサポート: 多くのユーザーがImageJを使用しており、コミュニティからのサポートを受けることができます。
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オープンソース: ImageJはオープンソースソフトウェアであり、自由に使用、改変、配布することができます。
関連動画
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